Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms