Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcnaP17918 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcnaP17918 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms