Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp53P15975 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp53P15975 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms