Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms