Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApcsP12246 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
ApcsP12246 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApcsP12246 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApcsP12246 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApcsP12246 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApcsP12246 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApcsP12246 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms