Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtcP11725 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtcP11725 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtcP11725 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtcP11725 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtcP11725 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtcP11725 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtcP11725 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtcP11725 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtcP11725 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OtcP11725 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtcP11725 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtcP11725 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtcP11725 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtcP11725 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtcP11725 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms