Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga5P11688 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga5P11688 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms