Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp1P11438 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lamp1P11438 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms