Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FlgP11088 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FlgP11088 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FlgP11088 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FlgP11088 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FlgP11088 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FlgP11088 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FlgP11088 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FlgP11088 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FlgP11088 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FlgP11088 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FlgP11088 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FlgP11088 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FlgP11088 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FlgP11088 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FlgP11088 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FlgP11088 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FlgP11088 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FlgP11088 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FlgP11088 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FlgP11088 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FlgP11088 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FlgP11088 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FlgP11088 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FlgP11088 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FlgP11088 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FlgP11088 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FlgP11088 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FlgP11088 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FlgP11088 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FlgP11088 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FlgP11088 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FlgP11088 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FlgP11088 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FlgP11088 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FlgP11088 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FlgP11088 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FlgP11088 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms