Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms