Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Schip1P0DPB4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Schip1P0DPB4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms