Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatspereP0DP43 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms