Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf2P09926 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf2P09926 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms