Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax1P09084 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax1P09084 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax1P09084 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax1P09084 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax1P09084 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax1P09084 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax1P09084 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax1P09084 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax1P09084 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax1P09084 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Pax1P09084 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pax1P09084 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pax1P09084 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax1P09084 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax1P09084 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax1P09084 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax1P09084 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax1P09084 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax1P09084 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax1P09084 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax1P09084 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax1P09084 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax1P09084 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms