Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NefmP08553 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NefmP08553 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NefmP08553 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NefmP08553 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NefmP08553 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NefmP08553 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NefmP08553 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NefmP08553 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NefmP08553 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NefmP08553 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NefmP08553 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NefmP08553 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NefmP08553 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NefmP08553 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefmP08553 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefmP08553 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NefmP08553 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NefmP08553 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NefmP08553 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NefmP08553 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NefmP08553 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NefmP08553 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NefmP08553 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NefmP08553 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefmP08553 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefmP08553 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefmP08553 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefmP08553 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefmP08553 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefmP08553 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefmP08553 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefmP08553 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NefmP08553 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NefmP08553 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NefmP08553 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NefmP08553 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefmP08553 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefmP08553 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefmP08553 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefmP08553 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefmP08553 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefmP08553 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefmP08553 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefmP08553 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefmP08553 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefmP08553 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefmP08553 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefmP08553 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefmP08553 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefmP08553 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefmP08553 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefmP08553 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NefmP08553 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms