Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NeflP08551 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NeflP08551 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NeflP08551 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NeflP08551 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NeflP08551 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeflP08551 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeflP08551 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeflP08551 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeflP08551 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeflP08551 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeflP08551 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeflP08551 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NeflP08551 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeflP08551 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeflP08551 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeflP08551 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeflP08551 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeflP08551 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeflP08551 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeflP08551 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeflP08551 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeflP08551 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeflP08551 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeflP08551 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms