Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa4P06728 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms