Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04212 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04212 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04212 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04212 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04212 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P04212 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P04212 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms