Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01798 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01798 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01798 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01798 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01798 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms