Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01796 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01796 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01796 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01796 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01796 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01796 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01796 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01796 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01796 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01796 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01796 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01796 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01796 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01796 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01796 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01796 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01796 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01796 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01796 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P01796 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01796 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01796 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms