Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01746 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01746 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01746 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01746 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01746 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01746 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01746 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01746 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01746 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01746 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms