Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01727 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01727 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01727 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01727 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P01727 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01727 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P01727 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01727 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01727 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01727 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01727 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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P01727 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01727 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01727 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01727 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01727 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01727 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P01727 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01727 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01727 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01727 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01727 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01727 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01727 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01727 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01727 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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P01727 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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P01727 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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P01727 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01727 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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P01727 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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P01727 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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P01727 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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P01727 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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P01727 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01727 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01727 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01727 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01727 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01727 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01727 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01727 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01727 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01727 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01727 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01727 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01727 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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