Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01724 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01724 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01724 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01724 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01724 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01724 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01724 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01724 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01724 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01724 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01724 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01724 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01724 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01724 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms