Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01667 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01667 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01667 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01667 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
P01667 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
P01667 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
P01667 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01667 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01667 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01667 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01667 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
P01667 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01667 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01667 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01667 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01667 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01667 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01667 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01667 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01667 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01667 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01667 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01667 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01667 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01667 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01667 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01667 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01667 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01667 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01667 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01667 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms