Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sypl2O89104 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sypl2O89104 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms