Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Robo1O89026 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Robo1O89026 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Robo1O89026 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Robo1O89026 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Robo1O89026 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms