Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setdb1O88974 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setdb1O88974 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms