Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JtbO88824 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
JtbO88824 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
JtbO88824 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JtbO88824 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JtbO88824 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JtbO88824 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JtbO88824 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JtbO88824 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JtbO88824 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JtbO88824 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JtbO88824 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JtbO88824 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JtbO88824 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JtbO88824 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JtbO88824 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JtbO88824 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JtbO88824 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JtbO88824 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms