Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1O88746 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1O88746 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tom1O88746 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1O88746 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1O88746 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1O88746 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tom1O88746 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1O88746 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1O88746 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms