Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ComtO88587 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ComtO88587 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ComtO88587 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ComtO88587 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ComtO88587 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ComtO88587 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ComtO88587 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ComtO88587 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ComtO88587 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ComtO88587 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ComtO88587 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ComtO88587 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ComtO88587 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ComtO88587 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ComtO88587 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ComtO88587 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ComtO88587 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ComtO88587 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ComtO88587 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ComtO88587 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ComtO88587 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ComtO88587 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ComtO88587 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ComtO88587 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ComtO88587 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ComtO88587 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ComtO88587 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ComtO88587 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ComtO88587 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ComtO88587 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ComtO88587 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ComtO88587 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ComtO88587 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ComtO88587 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ComtO88587 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ComtO88587 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ComtO88587 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ComtO88587 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ComtO88587 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ComtO88587 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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ComtO88587 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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ComtO88587 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ComtO88587 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ComtO88587 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ComtO88587 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ComtO88587 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ComtO88587 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ComtO88587 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ComtO88587 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ComtO88587 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ComtO88587 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ComtO88587 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ComtO88587 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ComtO88587 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ComtO88587 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ComtO88587 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ComtO88587 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ComtO88587 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ComtO88587 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms