Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp6O88572 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrp6O88572 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp6O88572 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms