Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3bO88509 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms