Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms