Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clec11aO88200 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec11aO88200 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms