Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms