Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1bO55017 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1bO55017 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms