Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlkO54988 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlkO54988 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SlkO54988 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SlkO54988 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SlkO54988 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SlkO54988 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlkO54988 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlkO54988 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlkO54988 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlkO54988 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SlkO54988 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms