Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema6bO54951 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sema6bO54951 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema6bO54951 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms