Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarce1O54941 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms