Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DffaO54786 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DffaO54786 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DffaO54786 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DffaO54786 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DffaO54786 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DffaO54786 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DffaO54786 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DffaO54786 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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