Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxO54751 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CrxO54751 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CrxO54751 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CrxO54751 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CrxO54751 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CrxO54751 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CrxO54751 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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