Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FxnO35943 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FxnO35943 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FxnO35943 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FxnO35943 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FxnO35943 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FxnO35943 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FxnO35943 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FxnO35943 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FxnO35943 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FxnO35943 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FxnO35943 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FxnO35943 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FxnO35943 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FxnO35943 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FxnO35943 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms