Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdk5r2O35926 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms