Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccl25O35903 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ccl25O35903 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ccl25O35903 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccl25O35903 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccl25O35903 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccl25O35903 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccl25O35903 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccl25O35903 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl25O35903 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms