Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf9O35739 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf9O35739 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf9O35739 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf9O35739 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms