Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NudcO35685 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NudcO35685 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NudcO35685 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NudcO35685 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NudcO35685 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NudcO35685 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NudcO35685 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NudcO35685 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NudcO35685 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NudcO35685 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NudcO35685 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NudcO35685 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NudcO35685 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NudcO35685 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NudcO35685 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NudcO35685 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NudcO35685 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NudcO35685 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NudcO35685 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NudcO35685 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NudcO35685 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NudcO35685 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NudcO35685 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NudcO35685 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NudcO35685 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NudcO35685 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NudcO35685 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NudcO35685 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NudcO35685 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NudcO35685 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NudcO35685 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms