Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx8O35652 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx8O35652 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms