Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn1mwO35599 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn1mwO35599 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms