Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema6aO35464 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms