Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TnxbO35452 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TnxbO35452 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TnxbO35452 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms